Bioinformatika: Apa perbedaan antara menyelaraskan satu fastq read pada STAR dan menyelaraskan dua fastq read pada STAR dengan satu sama lain? http://www.genefriends.org/RNAseqForDummies/


Jawaban 1:

Apa yang Anda maksud dengan satu fastq atau dua fastq? Apakah Anda mengacu pada bacaan ujung tunggal atau bacaan ujung berpasangan? Anda selalu dapat mengetahui perbedaan antara efisiensi ujung tunggal dan efisiensi urutan akhir berpasangan. Ini karena penangkapan dan liputan dan bermuara pada pengetahuan transkrip yang jauh lebih tinggi dengan artefak yang lebih sedikit dan hasil positif palsu.